內雙溪森林自然中心基本上屬於亞熱帶闊葉林生態系,但受到氣候的影響,104公頃的範圍內竟然出現多元的「壓縮型生態系」,可以發現熱帶闊葉林到溫帶闊葉林的生態特色,因此動植物資源更加豐富,是臺北市相當珍貴的自然資產!
因為受到東北季風強烈的影響,使得這裡海拔雖然不到500公尺,卻也可以在迎風面看到中高海拔的植物種類與生理現象,冬季的低溫時近山頂區域還會出現暖溫帶闊葉林的景緻。這種因為氣候的因素,使得中高海拔地區植物種類與生理現象朝北方低海拔地區下降的「北降現象」,在台灣屬於相當特殊的例子!
而同時,避風、暖濕溪谷中又可發現熱帶闊葉林的生態特色,例如幹生花、板根等,瞬間讓人好似走入自然科學博物館參觀一般,也讓內雙溪森林自然中心成為體驗各類型森林生態系的最佳戶外教室。